זוהי הפקודה bp_chaos_plotp שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו בחינם כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
bp_chaos_plot - עלילת כאוס מרצפי DNA ו-RNA
תַקצִיר
bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=OUTPUTFILE -g/--graphics=פורמט גרפי
-w/--width=WIGHT -h/--height=HEIGHT
תיאור
סקריפטים זה יוצר קובצי תמונה באמצעות ספריית תמונות GD כדי להמחיש נוקלאוטיד
רצפים באמצעות עלילת כאוס.
אפשרויות
פורמטים גרפיים חוקיים הם כרגע gd, gd2, png, wbmp, jpeg ו-gif.
גודל ברירת המחדל של קובץ התמונה הוא 600x400.
ניתן לספק את קלט הרצף באמצעות כל אחת משלוש השיטות:
טיעון ללא שם
שם קובץ bp_chaos_plot
טיעון בשם
bp_chaos_plot -i שם הקובץ
קלט סטנדרטי
bp_chaos_plot <שם קובץ
מָשׁוֹב
תפוצה רשימות
משוב משתמשים הוא חלק בלתי נפרד מההתפתחות של מודול זה ושל מודולים אחרים של ביופרל. לִשְׁלוֹחַ
ההערות וההצעות שלך רצוי לרשימת התפוצה של ביופרל. השתתפותך
מוערך מאוד.
[מוגן בדוא"ל] - דיון כללי
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - לגבי רשימות התפוצה
דווח באגס
דווח על באגים למערכת מעקב באגים ביופרל כדי לעזור לנו לעקוב אחר הבאגים ושלהם
פתרון הבעיה. ניתן להגיש דוחות באגים דרך האינטרנט:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
AUTHOR - ג'ייסון סטג'יץ'
כתובת אימייל [מוגן בדוא"ל]
הִיסטוֹרִיָה
קוד זה מבוסס על קוד EMBOSS C עבור chaos.c מאת איאן לונגדן. כלולים הם
תיעוד מקוד EMBOSS:
כאוס מייצר עלילת כאוס. היישום המקורי הוא חלק מהגנום של ACEDB
חבילת מסד נתונים, נכתבה על ידי ** Richard Durbin (MRC LMB, בריטניה) [מוגן בדוא"ל], ו
ז'אן תיירי-מיג (CRBM du CNRS, צרפת) [מוגן בדוא"ל]
השתמש ב-bp_chaos_plotp באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
