זוהי הפקודה bp_heterogeneity_testp שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו בחינם כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
bp_heterogeneity_test - מבחן להבחנה בין סלקציה לאוכלוסיה
הַרחָבָה.
תַקצִיר
הטרוגניות_מבחן -mut_1/--mutsyn נרדף_mut_count -mut_2/--mutnon nonsyn_mut_count
-s/--smaplesize sample_size [-i/--iterations iterations] [-o/--observed observed_D]
[-v/--verbose] [--silent ] [-m/--method tajimaD או fuD] [--precision]
תיאור
זהו יישום של מבחן ההטרוגנטיות כמתואר ב- Hahn MW, Rausher MD,
וקנינגהם CW. 2002. גנטיקה 161(1): 11-20.
אפשרויות
האפשרויות בסוגריים למעלה הן אופציונליות
-s או --samplesize samplesize
-mut_1 או --mutsyn ספירת מוטציות נרדפות
-mut_2 או --mutnon ספירת מוטציות לא סינונמיות
-i או --iterations מספר האיטרציות
-o או - נצפו ד
-m או --שיטה tajimaD או fuD עבור ה-D או Fu של Tajima וה-D של Li
-v או --verbose להדפיס הודעות מילוליות נוספות
--שקט היה שקט במיוחד
--precision רמת דיוק - ציין את מספר הספרות
(ברירת מחדל 4)
AUTHOR מתיו תרנגול
לפרטים נוספים:
מתיו האן, ג'ייסון סטג'יץ'
השתמש ב-bp_heterogeneity_testp באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
