זוהי הפקודה bp_remote_blastp שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות החינמיות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS.
תָכְנִית:
שֵׁם
bp_remote_blast.pl - סקריפט לשליחת עבודות לשרת פיצוץ מרוחק (ncbi blast queue
בשלב זה)
תַקצִיר
% bp_remote_blast.pl -p blastp -d ecoli -e 1e-5 -i myseqs.fa
תיאור
מודול זה יבצע פיצוץ מרחוק על קבוצת רצפים על ידי שליחתם ל-NCBI
תור פיצוץ והדפסת הפלט של הבקשה.
מָשׁוֹב
תפוצה רשימות
משוב משתמשים הוא חלק בלתי נפרד מההתפתחות של מודול זה ושל מודולים אחרים של ביופרל. לִשְׁלוֹחַ
ההערות וההצעות שלך רצוי לרשימת התפוצה של ביופרל. השתתפותך
מוערך מאוד.
[מוגן בדוא"ל] - דיון כללי
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - לגבי רשימות התפוצה
דווח באגס
דווחו על באגים למערכת מעקב הבאגים של ביופרל כדי לעזור לנו לעקוב אחר הבאגים והפעולות שלהם.
פתרון הבעיה. ניתן להגיש דוחות באגים דרך האינטרנט:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
AUTHOR - ג'ייסון סטג'יץ'
שלחו מייל לכתובת jason-at-bioperl-dot-org
השתמש ב- bp_remote_blastp באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
