זוהי הפקודה bp_seqretp שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות החינמיות שלנו כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS.
תָכְנִית:
שֵׁם
bp_seqret - יישום ביופרל של אחזור רצפים ממסד נתונים מקומי (כמו EMBOSS seqret)
נוהג
bp_seqret [-f/--format פלטפורמט] [-o/--out/--file קובץ פלט] [-d/--db שם מסד נתונים]
[-i/--id/-s/--seqname seqname1]
שימוש לדוגמא:
bp_seqret -f fasta -db db.fa -i seq1 -i seq2 > output.fas
bp_seqret db.fa:seq1 פלט.fas
bp_seqret db.fa:seq1 -o פלט.fas
bp_seqret -db db.fa -o output.fas seq1 seq2 seq3
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 פלט.fas
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 -> output.fas
צפוי שמאגר הנתונים יהיה קובץ רצף בפורמט Fasta עם מספר רצפים.
פורמט הפלט הוא Fasta כברירת מחדל.
אם לא סופק שם קובץ פלט, הפלט נכתב ל-STDOUT. מתן '-' כ-
שם קובץ הפלט יגרום לאותה פעולה.
השתמש ב-bp_seqretp באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
