זהו הפקודה cassiopee שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
cassiopee - דף מדריך עבור Cassiopee גרסה 1.0
תַקצִיר
cassiopee [אפשרויות]
תיאור
נוֹהָג:
-l: עומק אינדקס מרבי / גודל דפוס מרבי
-u: שמור אינדקס לשימוש מאוחר יותר
-s: רצף לאינדקס
-p: דפוס לחיפוש
-f: קובץ המכיל דפוס לחיפוש
-o: קובץ פלט
-r: החל הפחתת עצים
-m: מצב חיפוש: 0=DNA, 1=RNA, 2=חלבון
-a: אפשר חיפוש עמימות אלפביתית
-n: מקסימום N התאמות רצופות מותרות בחיפוש
-e: מקסימום התאמות מותרות החלפה בחיפוש
-i: מקסימום מותרות אינדל התאמות בחיפוש
-g: יוצר קובץ נקודות של הגרף
-d: עומק מרבי של הגרף
-t: פורמט פלט: 0:tsv (ברירת מחדל), 1:json
-x: מיקום מינימום ברצף
-y: מיקום מקסימלי ברצף
-v: גרסת הצג
-h: הצג הודעה זו
השתמש ב-Cassiopee באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
