זוהי הפקודה cmtk-reformatx שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
reformatx - מעצב מחדש של נפח
תַקצִיר
reformatx [אפשרויות] --floating floatingImg target x0 [x1 ...]
או reformatx [אפשרויות] יעד [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
או היכן x0 ... xN ו-xx0 ... xxN הוא [{-i,--inverse}] טרנספורמציה##. (אם הראשון
הטרנספורמציה ברצף הופכת, אז יש להקדים את '--inverse' ב-'--',
כלומר, השתמש ב-'-- --inverse xform.path').
תיאור
כלי מורחב לעיצוב מחדש של נפח לחישוב תמונות ומפות יעקוביאניות מחדש
רצפים שרירותיים של טרנספורמציות משורשרות
אפשרויות
גלוֹבָּלִי ארגז כלים אפשרויות (אלה יש לו משותף by את כל CMTK כלים)
- עזרה
כתוב רשימה של אפשרויות שורת פקודה בסיסיות לפלט סטנדרטי.
--לעזור לכולם
כתוב רשימה מלאה של אפשרויות שורת פקודה בסיסיות ומתקדמות לפלט סטנדרטי.
--וויקי
כתוב רשימה של אפשרויות שורת הפקודה לפלט סטנדרטי בסימון MediaWiki.
--איש
כתוב מקור דף אדם בסימון 'nroff' לפלט סטנדרטי.
--גִרְסָה
כתוב גרסת ערכת כלים לפלט סטנדרטי.
--הֵד
כתוב את שורת הפקודה הנוכחית לפלט סטנדרטי.
--רמת מילולית
הגדר את רמת הדיבור.
--מִלוּלִי, -v
הגדל את רמת המילוליות ב-1 (הוצא משימוש; נתמך עבור תאימות לאחור).
--חוטים
הגדר את המספר המרבי של שרשורים מקבילים (עבור שרשורי POSIX ו-OpenMP).
--סוג פלט
סוג נתונים סקלארי עבור תמונת הפלט. ערכים נתמכים: "char", "byte", "short",
"ushort", "int", "uint", "float", "double", או השתמש באחת מהאפשרויות הבאות:
--לְהַשְׁחִיר
8 ביטים, חתום
--בית
8 ביטים, לא חתום
--קצר
16 ביטים, חתום
--קצר
16 ביטים, לא חתום
--int
32 ביטים חתומים
--uint
32 סיביות ללא חתימה
--לָצוּף
32 סיביות נקודה צפה
--לְהַכפִּיל
64 סיביות נקודה צפה
--רפד החוצה , -P
ערך ריפוד לתמונת פלט [בְּרִירַת מֶחדָל: 0]
אפשרויות ל מישור פורמט מחדש
--שִׁרבּוּב
שיטת אינטרפולציה של תמונה. ערכים נתמכים: "ליניארי", "nn", "קוביק", "pv", "sinc-
cosine", "sinc-hamming", כאשר ברירת המחדל היא "לינארית", או השתמש באחת מהאפשרויות הבאות:
--לינארית
אינטרפולציה תלת-לינארית [זֶה is מה היא בְּרִירַת מֶחדָל]
--nn אינטרפולציה של השכן הקרוב ביותר
--מְעוּקָב
אינטרפולציה טריקובית
--pv אינטרפולציה חלקית של נפח
--sinc-cosinus
Sinc אינטרפולציה עם חלון קוסינוס
- מאז-המינג
Sinc אינטרפולציה עם חלון Hamming
--sinc-window-radius
רדיוס חלון עבור אינטרפולציה Sinc [בְּרִירַת מֶחדָל: 3]
--שימור-מסה
עיצוב מחדש לשימור המוני: הכפל כל ערך מחדש עם היעקוביאן
הקובע של הטרנספורמציה המיושמת.
אפשרויות ל יעקוביאני מַפָּה פורמט מחדש
--jacobian-correct-global
תקן מפות יעקוביאניות לקנה מידה עולמי.
--לא-ג'קובי-קורקט-גלובלי
אל תתקן מפות יעקוביאניות לקנה מידה עולמי. [זֶה is מה היא בְּרִירַת מֶחדָל]
קֶלֶט אפשרויות
---target-grid
הגדר את רשת היעד לשינוי מחדש כ-Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
(עמעומים:פיקסל:אופסט)
--מסכה, -m
השתמש בנתוני פיקסל יעד כמסיכה בינארית.
--יְבוּל
תמונת יעד חיתוך: x0,y0,z0,x1,y1,z2
--קיזוז יעד , -O
עוקף את היסט תמונת היעד והגדר ל-x,y,z mm
--- target-offset-pixels
בטל את היסט תמונת היעד והגדר לפיקסלים dx,dy,dz
--צָף , -F
פורמט ונתיב של תמונה צפה. [בְּרִירַת מֶחדָל: אף אחד]
--רפיד-צף
ערך ריפוד לתמונה הצפה [בְּרִירַת מֶחדָל: נָכֶה]
תְפוּקָה אפשרויות
--תיק , -o
פורמט ונתיב תמונת הפלט. [בְּרִירַת מֶחדָל: reformat.nii ]
תמונה/טרנספורמציה מסד נתונים
--db
נתיב למסד הנתונים של תמונה/טרנספורמציה שיש לעדכן במסד החדש שנוצר
תמונה. [בְּרִירַת מֶחדָל: אף אחד]
מחברים
טורסטן רוהלפינג, עם תרומות ממייקל פ. האסק, גרג ג'פריס, קלווין ר.
מאורר, דניאל ב' רוסקוף וירוסלב הלצ'נקו
השתמש ב-cmtk-reformatx באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
