זוהי הפקודה EDTSurf שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
EDTSurf - בנייה מהירה ומדויקת של משטחים מקרומולקולריים
תַקצִיר
EDTSurf -i pdbname...
תיאור
EDTSurf היא תוכנית קוד פתוח לבניית משטחים משולשים עבור מקרומולקולות. זה
יוצר שלושה משטחים מקרו-מולקולריים עיקריים: משטח ואן דר ואלס, נגיש לממס
משטח ומשטח מולקולרי (משטח ללא ממס). EDTsurf מזהה גם חללים
שנמצאות בתוך מקרומולקולות.
אפשרויות
-o שם חוץ
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-טהור 2-אטום 3-שרשרת
-p רדיוס בדיקה [0,2.0]
-f גורם קנה מידה (0,20.0]
-h 1-in ו-out 2-out 3-in
פלט1: outname.ply
פלט2: outname.asa
פלט3: outname-cav.pdb
השתמש ב-EDTSurf באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
