זוהי הפקודה extractBCITrees שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
extractBCITrees - חלק מחבילת mauveAligner קורא את כל העצים והחלק האחורי שלהם מא
קבוצה של קבצי MrBayes .trprobs
תַקצִיר
extractBCITrees <אקראי זרע> <BCI סף> <מקסימום תפוקה עצים> <מרבייס .trprobs קלט
פילה 1 .. N> <נקסוס תפוקה קובץ>
תיאור
תוכנית זו קוראת את כל העצים והאחוריים שלהם מקבוצה של קבצי MrBayes .trprobs ו
מסכם ומנרמל את האחוריים עבור כל טופולוגיה. כל העצים שפוגשים בייס קרידיבל
סף מרווח יישמר, עד למספר מקסימלי כלשהו של עצים. א
מספר בין 0 ל-1 נותן את סף BCI. 0.9 היא בחירה טובה.
עצים> הגבל את הפלט לעצים רבים כל כך. כל העצים בקובץ הקלט חייבים להיות
אותו מספר של טקסונים ואותם תוויות טקסונים
השתמש ב-extractBCITrees באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
