זהו הפקודה extractUnmappedSubreads שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו בחינם כגון Ubuntu Online, Fedora Online, Windows Online emulator או MAC OS Online emulator
תָכְנִית:
שֵׁם
extractUnmappedSubreads.py - חלץ קריאות משנה לא ממופה מקובץ fasta
תיאור
שימוש: extractUnmappedSubreads.py [-h] [--verbose] [--version] [--profile]
[--לנפות]
fasta cmp.h5 [cmp.h5 ...]
חלץ קריאות משנה לא ממופה מקובץ fasta.
מקומי טיעונים:
fasta קובץ fasta המכיל את כל קריאות המשנה.
קבצי cmp.h5 קלט cmp.h5.
אופציונלי טיעונים:
-h, - עזרה
הצג הודעת עזרה זו וצא
--מִלוּלִי, -v
הגדר את רמת הדיבור (ברירת מחדל: אין)
--גִרְסָה
הצג את מספר הגרסה של התוכנית וצא
--פּרוֹפִיל
הדפס פרופיל זמן ריצה ביציאה (ברירת מחדל: False)
--לנפות
תפוס חריגים ב-debuger (דורש ipdb) (ברירת מחדל: False)
השתמש ב-extractUnmappedSubreads באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
