זוהי הפקודה fastaq-to_fasta שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו בחינם כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
fastaq_to_fasta - ממיר מגוון פורמטים של קלט לפורמט FASTA מעוצב יפה
תיאור
שימוש: fastaq_to_fasta [אפשרויות]
ממיר מגוון פורמטי קלט לפורמט FASTA מעוצב יפה
מקומי טיעונים:
infile שם קובץ הקלט. יכול להיות כל אחד מ-FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip
אוסף
שם קובץ הפלט
אופציונלי טיעונים:
-h, - עזרה
הצג הודעת עזרה זו וצא
-l LINE_LENGTH, --אורך_שורה LINE_LENGTH
מספר הבסיסים בכל שורת רצף של קובץ הפלט. הגדר לאפס עבור לא
מעברי שורות ברצפים [60]
-s, --strip_after_whitespace
הסר הכל אחרי הרווח הלבן הראשון בכל שם רצף
-u, --check_unique
למות אם אחד משמות רצפי הפלט אינו ייחודי
השתמש ב-fastaq-to_fasta באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
