fastaq-trim_contigs - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

fastaq_trim_contigs - חותך מספר מוגדר של בסיסים מהקצה של כל קונטיג

תיאור

שימוש: fastaq_trim_contigs [אפשרויות]

חותך מספר מוגדר של בסיסים מהקצה של כל קונטיג, כך שהפערים הולכים וגדלים
קצוות מוסרים. הבסיסים מוחלפים ב-Ns. כל רצף שמסתיים בתור כל Ns הולך לאיבוד

מקומי טיעונים:
infile שם קובץ הקלט

אוסף
שם קובץ הפלט

אופציונלי טיעונים:
-h, - עזרה
הצג הודעת עזרה זו וצא

--trim_number TRIM_NUMBER
מספר הבסיסים שיש לקצץ סביב כל רווח, וקצוות של כל רצף [100]

השתמש ב-fastaq-trim_contigs באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net