זוהי הפקודה gbseqget שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
gbseqget - פורמט רצפים מ-GenBank כ-XML GBSet
תַקצִיר
gbseqget [-] [-d שם הקובץ] [-i שם הקובץ] [-m n/p/b] [-n] [-o שם הקובץ] [-v]
תיאור
gbseqget מאחזר נתוני רצף ביולוגי מ- GenBank (לפי רשימת קלט של GI
מספרי גישה) ומדפיס אותו כמסמך XML GBSet.
אפשרויות
סיכום האפשרויות כלול להלן.
- הדפס הודעת שימוש
-d שם הקובץ
קלט שם קובץ לרשימת התאריכים (הצטרפות רצויות, אחת בכל שורה, ואחריה א
שורה ריקה ורשימת תאריכים מותרים, גם אחד בכל שורה)
-i שם הקובץ
שם קובץ קלט עבור רשימת GI (ברירת מחדל = stdin)
-m n/p/b
סוג מולקולה:
n נוקלאוטיד (ברירת מחדל)
p חלבון
ב שניהם
-n החזר רק רשומות חדשות (שעבורן ה-GI הנתון מתייחס לגרסה ישנה)
-o שם הקובץ
שם קובץ פלט עבור XML GBSet (ברירת מחדל = stdout)
-v אחזר וריאציות SNP
אורים
פורמט GBSet הוצא משימוש לטובת INSDSet, שתוכל להפיק על ידי הפעלה
insdseqget במקום gbseqget.
השתמש ב-gbseqget באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net