זוהי הפקודה gmod_sort_gff3.plp שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות החינמיות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS.
תָכְנִית:
שֵׁם
gmod_sort_gff3.pl - ממיין קובץ GFF3 כך שיוצב שורות עם תגי Parent אחרי ההורה שלהם.
תַקצִיר
% gmod_sort_gff3.pl --infile
שורת הפקודה אפשרויות
--infile שם קובץ הקלט gff3 (נדרש)
שם קובץ הפלט gff3
(ברירת מחדל: sorted.gff)
תיאור
זהו סקריפט פשוט מאוד (ונבדק קלות בלבד) למיון קבצי gff3 כך שכולם
שורות המכילות תגיות אב מגיעות אחרי השורה המכילה את תגית הזיהוי של האב.
ממוינים כך נדרשים עבור מטעין בתפזורת GMOD chado, gmod_bulk_load_gff3.pl.
מחברים
סקוט קיין[מוגן בדוא"ל]>
זכויות יוצרים (ג) 2006
ספרייה זו היא תוכנה חופשית; ניתן להפיץ אותה מחדש ו/או לשנות אותה תחת אותו תנאי
מונחים כמו פרל עצמה.
השתמש בקובץ gmod_sort_gff3.plp באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
