זוהי הפקודה HPCmapper שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
HPCmapper - צור סקריפט למיפוי קריאות
תַקצִיר
HPCmapper [-vb] [-kint(20)] [-wint(6)] [-hint(50)] [-tint] [-Mint]
[-eכפול (.85)][-lint(1000)] [-sint(100)] [-Hint] [-mלעקוב]+ [-דאלint(4)] [-דרגהint(25)]
ref:db|dam קורא:db|dam [ראשון:int[-last:int]]
תיאור
HPCmapper כותב סקריפט מעטפת UNIX לפלט הסטנדרטי המורכב מרצף של
פקודות שלמעשה "מפות" כל קריאה ב-DB קורא כנגד קבוצת התייחסות של
רצפים ב-DB נ"צ, מקליט את כל היישורים המקומיים שנמצאו ברצף הקבצים
ref.reads.1.las, ref.reads.2.las, וכן הלאה, איפה ref.reads.k.las מכיל את היישורים
בין כולם נ"צ ובלוק הק' של קורא. הפרמטרים זהים בדיוק ל
ל HPCdaligner(1) שמור את זה -k, -h, ו -e ברירת המחדל מוגדרת כראוי עבור
מיפוי, וה -A ו -I אפשרויות לא הגיוניות כמו נ"צ ו קורא צפויים להיות
מערכי נתונים שונים.
אם המספרים השלמים ראשון ו אחרון חסרים, אז התסריט שהופק הוא עבור כל בלוק פנימה
בסיס הנתונים קורא. אם ראשון נוכח אז HPCmapper מייצר תסריט שמשווה
אבני ראשון דרך אחרון (אחרון = ראשון אם לא נוכח) נגד DAM נ"צ.
השתמש ב-HPCmapper באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net