זוהי הפקודה LAshow שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
LAshow - הצג יישורים מקומיים מקבצי .las
תַקצִיר
LAshow [-caroUF] [-iint(4)] [-wint(100)][-bint(10)] src1:db|dam [src2:db|dam] align:las
[כתוב: FILE | קורא: טווח ... ]
תיאור
LAshow מייצר רשימה מודפסת של היישורים המקומיים הכלולים ב-.las שצוין
קובץ, מהיכן מגיעות קריאות a ו-b src1 או מ src1 ו src2, בהתאמה. אם
נתון קובץ או רשימה של טווחי קריאה, ואז רק החפיפות שבהן נמצא ה-a-read
הסט שצוין על ידי הקובץ או הרשימה יוצגו. לִרְאוֹת DBshow(1) להסבר על
כיצד מתפרשים הקובץ ורשימת טווחי הקריאה.
אפשרויות
-F הפוך את התפקידים של קריאות a ו-b בתצוגה
-U השתמש באותיות גדולות עבור רצף DNA במקום באותיות קטנות המוגדרות כברירת מחדל
-iהֲזָחָה
הגדר את ההזחה עבור תצוגות הקריקטורה ו/או היישור אם הן מתבקשות.
(ברירת מחדל: 4)
-bמספרים_סימנים
הגדר את מספר הסמלים משני הצדדים של הקטעים המיושרים ביישור
לְהַצִיג. (ברירת מחדל: 10)
-ww פרמטר זה משמש עבור מצבי התצוגה המצוינים על ידי -a ו -r. (בְּרִירַת מֶחדָל:
100)
-o הצג רק יישורים שהם חפיפות נאותות - כלומר היכן שרצף מסתיים
מתרחש בכל קצה של היישור
תצוגה מצבים
-c עיבוד קריקטורה של היישור
-א, -r הצג יישור של היישור המקומי
אל האני -a אפשרות מציבה בדיוק w עמודות לכל קטע של התצוגה, בעוד שה -r אוֹפְּצִיָה
מעמיד בדיוק w א-קריאת סמלים בכל קטע של התצוגה. ה -r מצב תצוגה הוא
שימושי כאשר רוצים להשוות חזותית בין שני יישורים הכוללים אותו א-קריאה. אם
שילוב של -c, -a, ו -r דגלים מוגדרים, ואז הקריקטורה מגיעה קודם, ואז -a
יישור, ולבסוף את -r יישור.
השתמש ב-LAshow באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
