זוהי הפקודה maq.pl שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
maq.pl - סקריפט עוזר עבור maq
תַקצִיר
maq.pl [אפשרויות] [...]
תיאור
סקריפט עוזר עבור maq
גרסה: 0.4.7
אפשרויות.
easyrun
צינור פשוט עבור מערך נתונים קטן
הדגמה הדגמה של פונקציונליות maq (עבור SE בלבד)
מסנן SNP
סינון SNPs
מפת סטטיסטיקה
לחלץ נתונים סטטיסטיים מפלט השגיאה של 'מפת maq'
chrpt2snp
המר את קובץ chr_rpt של dbSNP לקובץ snp
ucsc2snp
המר את ה-SNP dump של UCSC לקובץ snp
fastq2bfq
המרת fastq באצווה
cat2pair
להמיר פורמט קריאה קצה מזווג
sv קוראים וריאציות מבניות
indelpe
פלט indelpe שלאחר עיבוד
השתמש ב-maq.pl באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
