mia-3dmotioncompica-nonrigid - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

mia-3dmotioncompica-nonrigid - רישום לא ליניארי של סדרה של תמונות תלת מימדיות.

תַקצִיר

mia-3dmotioncompica-nonrigid -i -o [אפשרויות]

תיאור

mia-3dmotioncompica-nonrigid תוכנית זו מיישמת גרסת תלת מימד של התנועה
אלגוריתם פיצוי המתואר ב-Wolny G, Kellman P, Santos A, Ledesma-Carbayo MJ,
"פיצוי תנועה אוטומטי של נשימה חופשית רכש נתוני זלוף שריר הלב על ידי
באמצעות ניתוח רכיבים עצמאיים", ניתוח תמונה רפואית, 2012,
DOI:10.1016/j.media.2012.02.004.

אפשרויות

קובץ-IO
-i --in-file=(קלט, נדרש); io
תמונות הזנה של מתויקות ממוספרות ברציפות (nameXXXX.ext) לנתמכים
סוגי קבצים ראה PLUGINS:3dimage/io

-o --out-file=(פלט, נדרש); io
שם תמונת פלט (כמחרוזת בפורמט C כולל %04d על מנת להגדיר
מספור הקבצים) לסוגי קבצים נתמכים ראה PLUGINS:3dimage/io

--save-refs=
לשמור תמונות עזר, המחרוזת הנתונה משמשת כבסיס שם הקובץ, ה
תבנית מספרים עוקבת אחר תמונות הקלט, ופורמט הפלט הוא תמיד
'נוֹף'

--save-regs=
שמירת תמונות ביניים רשומות, המחרוזת הנתונה משמשת כשם הקובץ
base, תבנית המספרים עוקבת אחר תמונות הקלט, ופורמט הפלט הוא
תמיד 'ויסטה'

--save-coeffs=
שמור מטריצת ערבוב לקובץ טקסט

--save-features=
שמור תמונות תכונה כ-PNG

עֶזרָה & מידע
-V --verbose=אזהרה
מילוליות של פלט, הדפסת הודעות ברמה נתונה ובעדיפויות גבוהות יותר.
סדרי עדיפויות נתמכים המתחילים ברמה הנמוכה ביותר הם:
מידע - הודעות ברמה נמוכה
להתחקות - מעקב אחר קריאת פונקציה
להיכשל - דיווח על כשלים בבדיקה
אזהרה - אזהרות
שגיאה - דיווח על שגיאות
באגים - ניפוי באגים בפלט
הודעה - הודעות רגילות
קטלני - דווח רק על שגיאות קטלניות

--זכויות יוצרים
להדפיס מידע על זכויות יוצרים

-h --עזרה
להדפיס עזרה זו

-? --נוֹהָג
הדפס עזרה קצרה

--גִרְסָה
להדפיס את מספר הגרסה ולצאת

הרשפ"ת
-C --components=0
רכיבי ICA 0 = הערכה אוטומטית רכיבי ICA 0 = אוטומטי
אומדן

--לא לנרמל
אל תנרמל ICs

--ללא רצועה
אל תסיר את הממוצע מעיקולי הערבוב

-k --דלג=0
דלג על תמונות בתחילת הסדרה, למשל כי כפי שהן של אחרים
אופנים דלג על תמונות בתחילת הסדרה, למשל בגלל שהם
הם באופנים אחרים

-m --max-ica-iter=400
מספר מקסימלי של איטרציות ב-ICA מספר מקסימלי של איטרציות ב-ICA

תהליך
--חוטים=-1
מספר שרשורים מקסימלי לשימוש לעיבוד, מספר זה צריך להיות נמוך יותר
או שווה למספר ליבות המעבד הלוגיות במכונה. (-1:
הערכה אוטומטית). המספר המרבי של שרשורים לשימוש לעיבוד, זה
המספר צריך להיות נמוך או שווה למספר ליבות המעבד הלוגיות ב
המכונה. (-1: אומדן אוטומטי).

הַרשָׁמָה
-O --optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
כלי אופטימיזציה משמש למזעור

-a --start-c-rate=32
התחל קצב קו-אפיציינט בעמודים, מחולק ב--c-rate-divider עם
כל קצב קוeficinet של התחלת מעבר בעמודים, מחולק ב--c-rate-divider
עם כל מעבר

--c-rate-divider=4
מחלק תעריף קופה עבור כל מחלק תעריף passcofficient עבור כל מעבר

-d --start-divcurl=20
משקל התחל divcurl, מחולק ב--divcurl-divider עם כל התחלה מעבר
משקל divcurl, מחולק ב--divcurl-divider בכל מעבר

--divcurl-divider=4
דרגת משקל divcurl עם כל שינוי משקל passdivcurl חדש עם כל אחד
מעבר חדש

-w --imagecost=image:weight=1,cost=ssd,
עלות תמונה

-l --mg-levels=3
רמות רזולוציה מרובות רמות רזולוציה מרובות

-P --עובר=3
רישום עובר רישום עובר

תוספים: 3Dimage/io

לנתח נתח תמונה 7.5

סיומות קבצים מוכרות: .HDR, .hdr

סוגי אלמנטים נתמכים:
8 סיביות ללא סימן, 16 סיביות בסימן, 32 סיביות בסימן, נקודה צפה 32 סיביות,
נקודה צפה 64 סיביות

מאגר נתונים IO וירטואלי למאגר הנתונים הפנימי וממנו

סיומות קבצים מזוהות: .@

dicom סדרת תמונות Dicom כתלת מימד

סיומות קבצים מוכרות: .DCM, .dcm

סוגי אלמנטים נתמכים:
חתום 16 סיביות, 16 סיביות ללא חתימה

hdf5 HDF5 תמונת תלת מימד IO

סיומות קבצים מוכרות: .H5, .h5

סוגי אלמנטים נתמכים:
נתונים בינאריים, 8 סיביות בסימן, 8 סיביות ללא סימן, 16 סיביות בסימן, 16 סיביות ללא סימן,
חתום 32 סיביות, 32 סיביות ללא סימן, 64 סיביות עם סימן, 64 סיביות ללא סימן, צף
נקודה 32 סיביות, נקודה צפה 64 סיביות

אינריה תמונה של INRIA

סיומות קבצים מוכרות: .INR, .inr

סוגי אלמנטים נתמכים:
חתום 8 סיביות, 8 סיביות ללא חתימה, 16 סיביות חתומות, 16 סיביות ללא חתימות, 32 חתומות
סיביות, 32 סיביות ללא סימן, נקודה צפה 32 סיביות, נקודה צפה 64 סיביות

Mhd תמונת MetaIO תלת-ממדית IO באמצעות מימוש VTK (ניסיוני).

סיומות קבצים מוכרות: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

סוגי אלמנטים נתמכים:
חתום 8 סיביות, 8 סיביות ללא חתימה, 16 סיביות חתומות, 16 סיביות ללא חתימות, 32 חתומות
סיביות, 32 סיביות ללא סימן, נקודה צפה 32 סיביות, נקודה צפה 64 סיביות

nifti NIFTI-1 תמונת תלת מימד IO

סיומות קבצים מוכרות: .NII, .nii

סוגי אלמנטים נתמכים:
חתום 8 סיביות, 8 סיביות ללא חתימה, 16 סיביות חתומות, 16 סיביות ללא חתימות, 32 חתומות
ביט, 32 סיביות ללא סימן, 64 סיביות בסימן, 64 סיביות ללא סימן, נקודה צפה 32
ביט, נקודה צפה 64 סיביות

vff פורמט רסטר VFF Sun

סיומות קבצים מוכרות: .VFF, .vff

סוגי אלמנטים נתמכים:
8 ביט לא חתום, 16 סיביות חתום

Vista תצוגה תלת מימדית

סיומות קבצים מוכרות: .V, .VISTA, .v, .vista

סוגי אלמנטים נתמכים:
נתונים בינאריים, 8 סיביות בסימן, 8 סיביות ללא סימן, 16 סיביות בסימן, 16 סיביות ללא סימן,
חתום 32 סיביות, ללא סימן 32 סיביות, נקודה צפה 32 סיביות, נקודה צפה 64
קצת

vti תמונה תלת מימדית VTK-XML ב-ופלט (ניסיוני).

סיומות קבצים מוכרות: .VTI, .vti

סוגי אלמנטים נתמכים:
חתום 8 סיביות, 8 סיביות ללא חתימה, 16 סיביות חתומות, 16 סיביות ללא חתימות, 32 חתומות
סיביות, 32 סיביות ללא סימן, נקודה צפה 32 סיביות, נקודה צפה 64 סיביות

vtk תמונת 3D VTK מדור קודם ופלט (ניסיוני).

סיומות קבצים מוכרות: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

סוגי אלמנטים נתמכים:
נתונים בינאריים, 8 סיביות בסימן, 8 סיביות ללא סימן, 16 סיביות בסימן, 16 סיביות ללא סימן,
חתום 32 סיביות, ללא סימן 32 סיביות, נקודה צפה 32 סיביות, נקודה צפה 64
קצת

דוגמא

רשום את סדרת הזילוף הניתנת בתמונות imagesXXXX.v באמצעות ICA 4-class
אוּמדָן. דלג על שתי תמונות בהתחלה, השתמש לכל היותר ב-4 שרשורי רישום, nlopt
כלי אופטימיזציה מבוסס ואחרים משתמשים בפרמטרי ברירת המחדל. אחסן את התוצאה ב
רשוםXXXX.v

mia-3dmotioncompica-nonrigid -i images0000.v -o רשום%04d.v -k 2 -C 4 -t 4 -O
nlopt:opt=ld-var1,xtola=0.001,ftolr=0.001,maxiter=300

מחבר(ים)

גרט וולני

זכויות יוצרים

תוכנה זו היא זכויות יוצרים (ג) 1999–2015 לייפציג, גרמניה ומדריד, ספרד. זה מגיע
ללא כל אחריות ואתה רשאי להפיץ אותו מחדש תחת תנאי ה-GNU
רישיון ציבורי כללי גרסה 3 (או מאוחר יותר). למידע נוסף הפעל את התוכנית עם
אפשרות '--זכויות יוצרים'.

השתמש ב-mia-3dmotioncompica-nonrigid באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net