פשוט - אונליין בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

פשוט - מונה הקילומטרים הברור מבוסס מערך

תַקצִיר

פשוט [-f|-r|-C] [-c דְחִיסָה] [-m mersize] -i קלט -o תפוקה

תיאור

פשוט הוא מונה סיביות פשוט מאוד. הוא מקצה מערך ענק של 32 סיביות, מאכלס את
מערך עם mers, ממיין וכותב את הפלט. הוא יקצה 4 בתים לכל kmer. k=16
ידרוש 16 ג'יגה-בייט כדי לפעול.

אפשרויות

-i קלט

-o תפוקה

-m mersize
גודל המר. ברירת המחדל היא 22

-f kmer קדימה (זוהי ברירת המחדל)

-r ק"מ הפוך

-C ק"מ קנוני (קטן יותר מבחינה לקסיקוגרפית מהק"מ הקדמי והאחורי בכל אחד מהם)
מִקוּם)

-c # דחיסת mer

השתמשו בשירותי onworks.net פשוטים באינטרנט