זוהי אפליקציית לינוקס בשם BIGSdb שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור bigsdb_1.24.1.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם BIGSdb עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
BIGSdb
תיאור
מסד הנתונים של רצף הגנום של Bacterial Isolate (BIGSdb) הוא מערכת מסד נתונים ניתנת להרחבה, נגישה לאינטרנט, שנועדה לאחסן ולנתח מידע פנוטיפי וגנוטיפי מקושר בצורה יעילה מבחינה חישובית. נתוני רצף יכולים לנוע מקריאה של רצף בודד ועד למספר קונטיגים שנוצרו על ידי טכנולוגיות רצף גנום שלם. המערכת משלבת את היכולת להגדיר ולזהות כל מספר של לוקוסים וגרסאות גנטיות באותם לוקוסים בתוך רצפי הנוקלאוטידים המאוחסנים. ניתן לארגן לוקוסים אלה עוד יותר בסכמות לאפיון מבודד או לניתוחים אבולוציוניים או פונקציונליים.ראה Jolley and Maiden 2010, BMC Bioinformatics 11:595 (http://www.biomedcentral.com/1471-2105/11/595).
אתה יכול לדווח על באגים או להגיש בקשות שיפור באמצעות מעקב הבעיות בכתובת https://github.com/kjolley/BIGSdb. גם קוד המקור משתקף שם.
קהל
מדע/מחקר, משתמשי קצה מתקדמים, מפתחים
ממשק משתמש
מבוסס רשת
שפת תכנות
פרל, JavaScript
סביבת מסד נתונים
PostgreSQL (pgsql)
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/bigsdb/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
