זוהי אפליקציית לינוקס בשם BiomeNet שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם BiomeNet.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם BiomeNet עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
BiomeNet
Ad
תיאור
מטאגנומיקה מניבה מספר עצום של רצפים מיקרוביאליים שניתן להקצות להם פונקציה מטבולית. השימוש בנתונים כאלה כדי להסיק על סטייה מטבולית ברמת הקהילה מפריע על ידי היעדר מסגרת סטטיסטית מתאימה. כאן, אנו מתארים מודל בייסיאני חדשני, הנקרא BiomeNet (הסקת בייסיאנית של רשתות מטבוליות), להסקת שכיחות דיפרנציאלית של רשתות מטבוליות בקרב קהילות מיקרוביאליות. כדי להסיק את המבנה של אינטראקציות מטבוליות ברמת הקהילה, BiomeNet מיישמת מסגרת של מודלים מעורבים למידע על שפע אנזימים. הרעיון הבסיסי הוא שמרכיבי התערובת של המודל (תגובות מטבוליות, תת-רשתות ורשתות) משותפים לכל הקבוצות (דגימות מיקרוביום), אך פרופורציות התערובת משתנות מקבוצה לקבוצה. באמצעות מסגרת זו, המודל יכול ללכוד מבנים מקוננים בתוך הנתונים. BiomeNet היא ייחודית במודלים של כל דגימת מטאנום כתערובת של מערכות מטבוליות מורכבות (מטאבוסיסטמות).
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
C++, S/R
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/biomenet/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
