זוהי אפליקציית לינוקס בשם CAMPARI להפעלה מקוונת בלינוקס, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כקובץ campari_v3_09052017.zip. ניתן להפעיל אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם CAMPARI כדי להריץ אותה בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
CAMPARI ירוץ בלינוקס אונליין
Ad
תיאור
אנו גאים להציג את גרסה 3 של CAMPARI. זהו צעד גדול מגרסה 2, בעיקר בשל התמיכה המקיפה ב-OpenMP (מקביליות של הליכים) ובשל שיפורים משמעותיים הן בשימושיות והן בביצועים. כמו כן, הוספנו שוב מספר אלגוריתמים חדשים מהספרות האחרונה, ו-CAMPARI כמובן ממשיך לתמוך בפרדיגמת שדה הכוח ABSINTH ובמודל הפתרון הגלום.CAMPARI היא חבילה משותפת לביצוע וניתוח סימולציות מולקולריות, ובפרט של פולימרים בעלי רלוונטיות ביולוגית. היא מתמקדת בזמינות רחבה של אלגוריתמים לדגימה (מתקדמת) ומסוגלת לשלב דגימה מונטה קרלו ודיגום דינמי מולקולרי בצורה חלקה. CAMPARI מציעה למשתמש רמת שליטה גבוהה מאוד על כל התכונות המיושמות. למידע נוסף ותכונות, אנא עיינו בדף הבית של הפרויקט בכתובת http://campari.sourceforge.netגרסה 2 אינה מתוחזקת באופן פעיל עוד, אך הגרסה הסופית ממשיכה להיות זמינה.
תכונות
- דגימת MC ו-MD משולבת, MD בחלל קרטזי או פיתול/קשיח-גוף
- הקבלה יעילה של OpenMP של כל שגרות אנרגיה/כוח הליבה
- ניתוח תוך כדי תנועה או ביצוע ככלי לניתוח מסלול (גם במקביל)
- שגרות ניתוח מובנות רבות (DSSP, מפות אנשי קשר, פונקציות מתאם זוג וכו')
- תמיכה במספר מקבצים מבניים ואלגוריתמים קשורים יחד עם ניתוחי מודל מצבי מרקוב
- מתועד מלא (html) ובנוסף נשלח עם 13 הדרכות
- רמת בקרה גבוהה מאוד (למשל, אילוצים הולונומיים מותאמים אישית ב-MD)
- תמיכה רחבה בטכניקות הדמיית ריפליקות מקבילות כמו החלפת העתקים בביצוע מקבילי MPI/OpenMP היברידי
- מתקן ניתוח עצמאי עבור מתקני מודל מקבץ/מדינת מרקוב
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
קונסולה/טרמינל
שפת תכנות
פורטרן
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/campari/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
