זוהי אפליקציית לינוקס בשם dataMAPPs להפעלה מקוונת בלינוקס, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כ- dataMAPPs_3.2.7.zip. ניתן להפעיל אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם dataMAPPs כדי להריץ אותה בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
dataMAPPs להפעלה מקוונת בלינוקס
תיאור
dataMAPPs מאפשר עיבוד שגרתי ויעיל של נתונים ממחקרי אימונוגניות תוך שימוש בטכנולוגיית MAPPs peptidomics כדי לזהות אפיטופים פוטנציאליים של MHCI- או MHC-II כפי שהוצגו על ידי תאים דנדריטים (DC).הוא כולל בקרת איכות של הנתונים הגולמיים, נורמליזציה בין דגימות/כל תורמים והדמיה של תוצאות בסגנון מפת חום (heatMAPPs). הליבה של dataMAPPs היא ספריית R גנרית שניתן להתאים לפרויקטים ספציפיים באמצעות סקריפטים ייעודיים לשליטה המאפשרים גם חישוב מחדש של תוצאות.
עיין בקובץ README לקבלת הוראות התקנה ושימוש. תיעוד נוסף מסופק בפורמט PDF.
dataMAPPs מתפרסם תחת רישיון GPL על ידי צוות של מדענים העובדים עבור Hoffmann-La Roche AG בבאזל, שוויץ. התוכנה מסופקת כפי שהיא, כדי להועיל לחוקרים אחרים.
פרסום בהכנה:
שטיינר ואחרים, 'הפעלת פרוטאומיקה שגרתית של פפטידים הקשורים ל-MHC-II (MAPPs) להערכת סיכונים של אימונוגניות מושרה על ידי תרופות'
תכונות
- ייבוא של נתוני פפטידומיקה (פלט PEAKS, אך עשוי להיות מורחב)
- QC נרחב של נתונים ואי הכללת דגימות על ידי חיתוכים הניתנים להגדרה על ידי המשתמש
- הליך נורמליזציה ייעודי דו-שלבי עבור נתוני MAPPs
- מיפוי פפטידים לנוגדן/חלבון יעד
- קיבוץ מיקומי מיפוי פפטידים לאזורי אפיטופ נקודה חמה
- הדמיה של תוצאות מיפוי כמפות חום
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
קונסולה/טרמינל
שפת תכנות
S / R
סביבת מסד נתונים
קובץ שטוח
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/datamapps/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
