זוהי אפליקציית לינוקס בשם Digital Expression on the Web, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם dew_RC2.tar.bz2. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל אונליין את האפליקציה הזו בשם Digital Expression on the Web with OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
ביטוי דיגיטלי ברשת
Ad
תיאור
DEW היא פלטפורמה המאפשרת למשתמשים לחקור נתוני RNA-Seq. ממשק משתמש גרפי מבוסס אינטרנט כלול.
הניתוח מתנהל כך: יישורי פערים מבוצעים ומתוקנים לאורך, PCR והטיה של הפרגמנטים, כך שמוענק פרגמנט לקילובאז (אפקטיבי) למיליון קריאות (FPKM), כמו גם קריאות לקילו-בסיס למיליון קריאות (RPKM) הפשוטות יותר. כאשר הנתונים מסופקים עם מספר איזופורמים ובמצב 'הקשרי', התיקונים כוללים אלגוריתם מקסום ציפיות שמעריך פרופילי ביטוי אפקטיביים ומיוצר יישור מתוקן. עבור כל גן שהמשתמש מספק, DEW מחשב סטטיסטיקות תיאוריות של כיסוי (RPKM, FKMP וספירות מתוקנות כוללות, ממוצעות וחציון), פרופילי ביטוי (מנורמלים כ-R/FPKM וממוצע גזום של שינוי קיפול). DEW מאפשר למשתמשים לחקור את הנתונים על ידי מתן גרפים אינטראקטיביים.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
מבוסס רשת
שפת תכנות
פרל, ג'אווהסקריפט, חיפוש/המרה
סביבת מסד נתונים
SQLite
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מ-https://sourceforge.net/projects/dew/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
