זוהי אפליקציית לינוקס בשם FastQC שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור v0.12.1sourcecode.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם FastQC עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
FastQC
תיאור
FastQC הוא כלי ניתוח בקרת איכות שנועד לזהות בעיות פוטנציאליות במערך נתונים של רצף תפוקה גבוהה. מטרתו היא לספק דרך פשוטה לבדיקת איכות נתוני הרצף הגולמיים המגיעים מצינורות רצף תפוקה גבוהה. זה עושה זאת על ידי הפעלת סט מודולרי של ניתוחים על קובץ רצף גולמי אחד או יותר בפורמט fastq או bam. לאחר מכן הוא מייצר דוח המסכם את התוצאות, ומדגיש את כל האזורים שבהם הספרייה עשויה להיראות חריגה. זה אמור להפנות אותך למקום שבו הנתונים שלך עלולים להיתקל בבעיות ולאפשר לך לנקוט בצעדים הדרושים כדי לתקן אותם לפני שתבצע ניתוח נוסף.
FastQC אינו קשור לשום סוג ספציפי של טכניקת רצף, כך שניתן להשתמש בו כדי להסתכל על ספריות מסוגי ניסויים שונים (ריצוף גנומי, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq וכו' וכו').
תכונות
- מייבא נתונים מקבצי BAM, SAM או FastQ
- מציע סקירה מהירה המדגישה אזורים בעייתיים פוטנציאליים
- גרפים וטבלאות סיכום להערכה מהירה של נתונים
- ייצוא תוצאות ל-HTML
- ניתן להשתמש במצב לא מקוון
שפת תכנות
Java
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
