זוהי אפליקציית לינוקס בשם Hamstr, שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Hamstr עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
Hamstr
Ad
תיאור
HaMStR עבר ל https://github.com/bionf/hamstr שם הוא כעת חלק מחבילת HaMStR-OneSeq.
HaMStR הוא כלי המבוסס על מודל מרקוב נסתר על פרופיל לחיפוש אורתולוגי מכוון בנתוני EST או רצף חלבונים. התוכנית לוקחת קבוצת ליבה מוגדרת מראש של רצפים אורתולוגיים (אורתולוגים ליבה) וקבוצה של רצפים מטקסון חיפוש כקלט. לאחר מכן, HaMStR משלב באסטרטגיה דו-שלבית חיפוש מבוסס pHMM וחיפוש הפוך באמצעות BLAST כדי להרחיב את קבוצת האורתולוג הליבה עם רצפים חדשים מטקסון החיפוש.
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
פרל
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/hamstr/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
