זוהי אפליקציית לינוקס בשם High-Throughput Tabular Data Processor, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם htdpinstaller.exe. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם מעבד נתונים טבלאיים בעל תפוקה גבוהה עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
מעבד נתונים טבלאיים בעל תפוקה גבוהה
תיאור
מעבד נתונים טבלאיים HIGH-THROUGHPUT (HTDP) הוא יישום Java שנועד להקל על משימות חיפוש וחיזור נתונים בקבצי טקסט גדולים הנובעים מטכנולוגיות תפוקה גבוהה, למשל ריצוף מקבילי מסיבי או מיקרו-מערכים. התוכנה מותאמת לנתוני מיקרו-מערכים וריצוף מקבילי עמוק, אולם היא יכולה לקבל כל מערך נתונים טבלאי מופרד בתווים. HTDP יכול גם לייבא, לעבד ולהמיר קבצי Variant Call Format (VCF) גרסאות 4.0, 4.1 ו-4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP מספק פונקציונליות סינון מהירה ויכול לעבד נתונים המורכבים מקובץ קלט יחיד או מרובים.
ציטוט: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, ואחרים (2018) מעבד נתונים טבלארי בעל תפוקה גבוהה - כלי גרפי בלתי תלוי בפלטפורמה לעיבוד מערכי נתונים גדולים. PLoS ONE 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
תכונות
- עובד על כל נתוני עמודה מופרדים בתווים (למשל BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- מיזוג קבצי נתונים טבלאיים אנכית ואופקית
- מיזוג כל קובץ נתונים טבלאי באמצעות מיקום הגנום או עמודה/ות משותפות
- יכולות סינון וצמצום נתונים בלתי מוגבלות
- ניתן לנתח בו זמנית קבצים שונים מבחינת פורמט ותוכן
שפת תכנות
Java
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מ-https://sourceforge.net/projects/htdp/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
