זוהי אפליקציית לינוקס בשם iMSAT להפעלה ב-Linux באינטרנט, שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור SSRs.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם iMSAT כדי לרוץ בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
iMSAT לפעול בלינוקס מקוון
תיאור
iMSAT מייצג עדכון מלא של תוכנית vcf2MSAT. תוכנית python שורת פקודה זו מאפשרת למשתמש להשתמש בנתוני הפולימורפיזם שנוצרו באמצעות כלי SAM ו-BAM וקובץ יישור .fasta כדי לחפש סמני מיקרו-לווין פולימורפיים (MSATs או STRs). על ידי זיהוי יצרנים פולימורפיים, במקום אזורים חוזרים פשוטים כפי שעשו תוכניות קודמות, iMSAT מגדיל מאוד את המהירות שבה MSATs פולימורפיים שניתן לזהות - חוסך לחוקרים זמן וכסף יקרים. לְבַקֵר http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract למאמר PDF המתאר את התועלת של iMSAT ואם אתה משתמש בתוכנה אנא ציין מאמר זה כ: Andersen and Mills: iMSAT: גישה חדשה לפיתוח לוקוסים מיקרו-לווייניים באמצעות ספריות Illumina מקודדות. BMC Genomics 2014 15:858.תכונות
- זיהוי מיקרולווין פולימורפי
- Illumina Sequencing
- ניתוח גנומי
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
פיתון
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/imsat/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
