זוהי אפליקציית לינוקס בשם misc genomics tools שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם misc_genomics_tools_v0.2.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם misc genomics tools עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
כלים גנומיים שונים
תיאור
זהו אוסף של תוכניות שונות שפותחו במהלך פרויקט גנומיקה, הכולל את זן Pseudomonas NCIMB10586
אלו כוללים
* זיהוי ותיקון שגיאות ברצף הגנום של pacbio (למשל) באמצעות illumina reads
* ביאור רצף פרוקריוטי/גנום
* ניתוח RNAseq - נורמליזציה ואיסוף של מספר דגימות כקבוצה
* הדמיית RNAseq
כל הסקריפטים מסופקים על בסיס 'מיטב המאמצים', אולם עקב שינויים שונים במערכת אני לא מבטיח שכל הקבצים הם הגרסה המשמשת בניתוח.
כמו כן, אנא שימו לב כי אלה פותחו מאוד מתוך מחשבה על כדאיות - כלומר, התהליך היה צפוי להתבצע בצורתו הסופית פעם אחת; הקפדה קטנה ניתנה על אופטימיזציה של זמן הריצה או שרשרת סקריפטים יחד, ולפעמים יש גישה ידנית למשאבים חיצוניים.
תכונות
- תיקון שגיאות ברצף הגנום
- ביאור רצף פרוקריוטי
- נורמליזציה של RNAseq של מספר דגימות כקבוצה
- הדמיה של סדרת דגימת RNAseq/קורס זמן
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
פרל
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מאתר https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
