זוהי אפליקציית לינוקס בשם Molecular Dynamics Studio אשר את המהדורה האחרונה שלה ניתן להוריד כ-WindowsRelease.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Molecular Dynamics Studio עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
סטודיו מולקולרית דינמיקה
תיאור
זהו אוסף של שינויים בתוכנה שנוצרו כדי לשלב את NanoEngineer-1, PACKMOL ו-MSI2LMP לצורך יצירת תאים דינמיים מולקולריים בקלות. NanoEngineer-1 היא תוכנת CAD מולקולרית שנכתבה על ידי Nanorex ומספקת למשתמש דרך קלה ליצור מולקולות, בעוד ששינויי התוכנה מאפשרים למשתמש להקליד אטומים באמצעות שדות כוח מרובים. PACKMOL יכולה ליצור אוסף אקראי של מולקולות באמצעות תבניות המולקולה של NanoEngineer-1 ובכך לספק את תא ה-MD הראשוני. שינויים ב-PACKMOL מאפשרים להעביר את נתוני סוג האטום לתוכנת MSI2LMP. MSI2LMP יוצר קובץ קלט LAMMPS המבוסס על שדות כוח מסוג Class I או Class II. MSI2LMP שונה לשימוש בנתוני שדות כוח מקודדים מספריים שנוצרו על ידי NanoEngineer-1. פורמט הקובץ MMP הוארך ושולב בכל שלושת יישומי התוכנה.
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
תכונות
- יכולת CAD מולקולרית באמצעות NanoEngineer-1
- הקלד ידני אטומים על סמך שדה הכוח האטומי CFF91
- צור תבניות מולקולות באמצעות NanoEngineer-1
- צור תא MD באמצעות PACKMOL ותבניות מולקולות מרובות
- צור קובץ קלט גיאומטריית LAMMPS באמצעות MSI2LMP
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
OpenGL, Qt
שפת תכנות
Fortran, Python, C++, C
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
