זוהי אפליקציית לינוקס בשם multipsq, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כקובץ multiPSQ_1.1.0_windows_x86.zip. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל אונליין את האפליקציה הזו בשם multipsq עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
מרובי מקטעים
תיאור
תוכנה לסיווג אורגניזמים המבוססת על תוצאות מאלגוריתמי פירוזצ'ינג מרובי-פלקס שבוצעו במערכת Pyro-Mark ID System (Qiagen). ניתן לתכנן את המבחנים באמצעות התוכנה mpsqed הזמינה מ- https://sourceforge.net/projects/mpsqed/
ניתן להשתמש בפירוזה (Pyrosequencing) לצורך הקלדה של פתוגנים המבוססים על פולימורפיזם של נוקלאוטיד יחיד (SNP) או לצורך מתן מידע על רצף של קטעי DNA קצרים. עם זאת, עבור חלק מהפתוגנים לא ניתן לבצע הקלדה מולקולרית בהסתמך על SNP יחיד או קטע רצף קצר, דבר המחייב התחשבות במספר אזורים גנומיים. גישה מהירה ומבטיחה היא יישום סימולטני של פריימרים מרובים של ריצוף, הנקראים פירוזה מולטיפלקס (multiplex pyrosequencing). פריימרים אלה יוצרים פירוגרם של טביעת אצבע המורכב מסכום כל הפירוגרמות הבודדות שמקורן בכל פריימר בו נעשה שימוש. MultiPSQ מאפשר ניתוח וסיווג של פירוגרמות מולטיפלקס שמקורן בפריימרים שונים של פירוזה.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
Qt
שפת תכנות
C + +
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מ-https://sourceforge.net/projects/multiplsq/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
