זוהי אפליקציית לינוקס בשם QUASR שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור QUASR_v6.08.tar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם QUASR עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
QUASR
תיאור
QUASR הוא צינור קל משקל שנכתב לעיבוד וניתוח נתוני רצף הדור הבא (NGS) מפלטפורמות Illumina, 454 ו-Ion Torrent. למרות שנכתב במקור עבור נתונים ויראליים, הוא מספיק גנרי כדי לעבוד על כל מערך נתונים של NGS. הפונקציות כוללות:
הסרה כפולה
דה-מולטיפלקס
הסרת פריימר
אבטחת איכות (QA) גרפים
בקרת איכות (QC)
יצירת קונצנזוס
קביעת וריאציות מיעוט
גרף של וריאציות מיעוט
הגרסה הנוכחית הראשית היא 6.X, שנכתבת ב-Python3. 7.X הוא השכתוב שלי בג'אווה, אבל הוא עדיין בתהליך עבודה. שניהם כתובים להיות קלים ככל האפשר, כך שהם יכולים לפעול עם דרישות זיכרון מינימליות במחשב שולחני או במחשב נייד, כמו גם באשכול מחשוב.
אם יש לך בעיות כלשהן עם QUASR, אנא צור איתי קשר בכתובת הדוא"ל שצוינה ב-README.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
פיתון
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/quasr/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.