זוהי אפליקציית לינוקס בשם SplitMEM שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור splitmem.1.0.tgz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם SplitMEM עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
SplitMEM
Ad
תיאור
עם עלייתן של טכנולוגיות רצף משופרות, הגנומיקה מתרחבת מפרדיגמת התייחסות יחידה לכל מין לגישה של פאן-גנום מקיפה יותר עם מספר פרטים מיוצגים ומנתחים יחד. כאן אנו מציגים אלגוריתם חדש של זמן ומרחב O(n log n) בשם splitMEM, הבונה ישירות את גרף דה Bruijn הדחוס עבור פאן-גנום באורך כולל n. כדי להשיג מורכבות זמן זו, אנו מגדילים את עץ הסיומת בדילוגים על סיומת, מבנה חדש המאפשר לנו לעבור מספר קישורי סיומת בזמן קבוע, ולהשתמש בהם כדי לפרק ביעילות התאמות מדויקות מקסימליות (MEMs) במהלך חציית עץ סיומת.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
C + +
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/splitmem/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.