זוהי אפליקציית לינוקס בשם SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster להפעלה מקוונת בלינוקס, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz. ניתן להפעיל אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster כדי להריץ אותה בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
SWAPHI-LS: יישור על אשכול Xeon Phi להפעלה מקוונת בלינוקס
Ad
תיאור
אלגוריתם סמית'-ווטרמן המקביל הראשון המנצל אשכולות של Intel Xeon Phi כדי להאיץ את היישור של רצפי DNA ארוכים. אלגוריתם זה כתוב ב-C++ (עם סט של הרחבות SIMD פנימיות), OpenMP ו-MPI. הערכת הביצועים גילתה שהאלגוריתם שלנו משיג ביצועים יציבים מאוד, ומניב ביצועים של עד 30.1 GCUPS על Xeon Phi יחיד ועד 111.4 GCUPS על ארבעה Xeon Phis החולקים מארח.קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
קונסולה/מסוף, שורת פקודה
שפת תכנות
C + +
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מ-https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
