זוהי אפליקציית לינוקס בשם SWAPHI: Smith-Waterman ב-Intel Xeon Phi שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור swaphi-v1.0.5.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם SWAPHI: Smith-Waterman על Intel Xeon Phi עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
SWAPHI: Smith-Waterman על Intel Xeon Phi
Ad
תיאור
האלגוריתם המקביל הראשון להאיץ את חיפוש מסד הנתונים של חלבון Smith-Waterman במארח משותף במספר מעבדי שותפים משותפים של Intel Xeon Phi. על ידי חיפוש מול מסד הנתונים UniProtKB/TrEMBL, SWAPHI משיג ביצועים של עד 58.8 מיליארד עדכוני תאים בשנייה (GCUPS) ב-Xeon Phi בודד ועד 228.4 GCUPS בארבעה Xeon Phis.
קהל
מדע/מחקר, חינוך, הנדסה
ממשק משתמש
.NET/מונו, קונסולה/טרמינל
שפת תכנות
C++, ALGOL 68
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/swaphi/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
