זוהי אפליקציית Windows בשם clusterProfiler שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם clusterProfilersourcecode.tar.gz. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם clusterProfiler עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
בצילומי מסך
Ad
פרופיל אשכולות
תיאור
clusterProfiler היא חבילת R/Bioconductor המספקת זרימת עבודה מאוחדת לניתוח העשרה פונקציונלית כדי לפרש תוצאות אומיקס בתפוקה גבוהה. היא תומכת הן בניתוח ייצוג יתר והן בניתוח העשרה של מערכי גנים, ומאפשרת לך לעבוד עם רשימות גנים לא מדורגות או סטטיסטיקות מדורגות מצינורות דיפרנציאליים. החבילה מתחברת לבסיסי ידע מרובים - כגון Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH ואחרים - באמצעות ממשק עקבי כך שתוכל לבצע שאילתות על עדשות ביולוגיות שונות מבלי לכתוב מחדש את הקוד. היא מיועדת לרוחב, ומכסה תכונות קידוד ולא קידוד ואלפי אורגניזמים על ידי מינוף הערות המתעדכנות באופן רציף. התוצאות מוחזרות במבנים מסודרים וידידותיים למניפולציה ומשודכות באופן טבעי עם פונקציות ויזואליזציה עשירות (באמצעות כלי עבודה נלווים) כדי לסכם מסלולים, מונחים וקשרים בין גנים למערכי גנים.
תכונות
- זרימות עבודה מאוחדות של ORA ו-GSEA על פני מקורות ביאורים מרובים
- תמיכה רחבה במינים באמצעות ביאורים גנטיים עדכניים
- פלטים מסודרים שמשתלבים בצורה נקייה עם צינורות נתונים של R במורד הזרם
- ויזואליזציה מובנית של תוצאות העשרה באמצעות כלי התוויית תוצאות נלווים
- כלי עזר להשוואה מרובת קבוצות (למשל, compareCluster) לניתוח בין-תנאים
- וינייטות ומדריכים מפורטים למחקרי העשרה מקצה לקצה, הניתנים לשחזור
שפת תכנות
R
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מאתר https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
