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afetch - クラウドでオンライン

Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターを介して、OnWorks の無料ホスティング プロバイダーで afetch を実行します。

これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド afetch です。

プログラム:

NAME


afetch - アライメントデータベースからアライメントを取得します

SYNOPSIS


フェッチ [オプション] アライメントデータベース キー

フェッチ - 索引 アライメントデータベース

DESCRIPTION


フェッチ という名前のアライメントを取得します キー ファイル内のアライメント データベースから アライメントデータベース。

アライメントデータベース ストックホルムの「多重マルチアライメント」ファイルです (ネイティブ Pfam など)
形式でダウンロードすることができます。

キー アライメントの名前 (ID) またはそのアクセッション番号 (AC) のいずれかです。

当学校区の アライメントデータベース ファイルは最初に SSI インデックスを作成する必要があります フェッチ - 索引 効率的な
検索。 SSI インデックスは必須ではありませんが、SSI インデックスを使用しないアライメントの取得は可能です。
痛いほど遅い。

OPTIONS


-h 簡単なヘルプを印刷します。 バージョン番号とすべてのオプションの概要が含まれます。
エキスパートのオプション。

EXPERT OPTIONS


- 索引
を取得する代わりに、 キー、 特別なコマンド フェッチ - 索引 アライメントデータベース
ファイル内のアライメントの名前とアクセッションの SSI インデックスを生成します
アライメントデータベース。 これは、上で XNUMX 回実行する必要があります。 アライメントデータベース ファイルを作成してすべてを準備します
将来のアフェッチ。

onworks.net サービスを使用してオンラインで afetch を使用する


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Windows と Linux のアプリをダウンロード

Linuxコマンド

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