これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド afetch です。
プログラム：
NAME
afetch - アライメントデータベースからアライメントを取得します
SYNOPSIS
フェッチ [オプション] アライメントデータベース キー
フェッチ - 索引 アライメントデータベース
DESCRIPTION
フェッチ という名前のアライメントを取得します キー ファイル内のアライメント データベースから アライメントデータベース。
アライメントデータベース ストックホルムの「多重マルチアライメント」ファイルです (ネイティブ Pfam など)
形式でダウンロードすることができます。
キー アライメントの名前 (ID) またはそのアクセッション番号 (AC) のいずれかです。
当学校区の アライメントデータベース ファイルは最初に SSI インデックスを作成する必要があります フェッチ - 索引 効率的な
検索。 SSI インデックスは必須ではありませんが、SSI インデックスを使用しないアライメントの取得は可能です。
痛いほど遅い。
OPTIONS
-h 簡単なヘルプを印刷します。 バージョン番号とすべてのオプションの概要が含まれます。
エキスパートのオプション。
EXPERT OPTIONS
- 索引
を取得する代わりに、 キー、 特別なコマンド フェッチ - 索引 アライメントデータベース
ファイル内のアライメントの名前とアクセッションの SSI インデックスを生成します
アライメントデータベース。 これは、上で XNUMX 回実行する必要があります。 アライメントデータベース ファイルを作成してすべてを準備します
将来のアフェッチ。
onworks.net サービスを使用してオンラインで afetch を使用する
