これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド arden-analyze です。
プログラム：
NAME
arden-analyze - 人工参照ゲノム マッピングの結果を分析する
SYNOPSIS
アーデン分析 [オプション] [入力 FILE] [出力フォルダ]..。
DESCRIPTION
人工参照ゲノム マッピングの結果を分析するスクリプト。 このスクリプト
特定のデータセット (読み取り) の推定 TP / FP を識別します。
OPTIONS
出力フォルダ
出力先フォルダへのパス。
入力 FILE
ini ファイルへの ppath。 必要な形式を取得するには、サンプル ファイルを参照してください。
- バージョン
プログラムのバージョン番号を表示して終了します
-h, - 助けて
このヘルプメッセージを表示して終了します
-p フレッド、 --フレッド=フレッド
入力読み取りの PHRED エンコーディングを指定します。つまり、Illumina 1.3+ = -p 33.[デフォルト:
33]
-r ランク、 --内部ランク=RANK
読み取りに内部ランキングを使用する (読み取り名を取得できない場合に必要)
python と sam による OS で同じ方法で辞書順にソートする
ツール).[デフォルト:1]
onworks.net サービスを使用してオンラインで arden-analyze を使用する
