これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド bam-read です。
プログラム:
NAME
bam-read - マルチマッピング読み取りが割り当てられた後に bam ファイルを解析し、読み取りを集約します
コンティグによるマッピング情報。
SYNOPSIS
現在捕獲されているもの:
- 名前
- マッピングされた塩基
- 距離を編集する
- 橋
- 長さ
- マッピングされた読み取り
- 両方がマッピングされている
- 適切なペア
- 良い
- 覆われていない基地
- 平均マップq
- カバレッジが分割されていない可能性
DESCRIPTION
bam-read バージョン 1.0.0 使用法: bam-read
例: bam-read in.bam out.csv 0.95
使用法: バム読み取り
例: bam-read in.bam out.csv 0.95
onworks.net サービスを使用してオンラインで bam-read を使用する