これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレータ、MAC OSオンラインエミュレータなど、複数の無料オンラインワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドbowtie-inspect-debugです。
プログラム：
NAME
bowtie-inspect - bowtie インデックスから情報を抽出します
SYNOPSIS
蝶ネクタイ検査 [オプション]*
DESCRIPTION
ebwt ファイル名から末尾の .1.ebwt/.2.ebwt を除いたもの
デフォルトでは、インデックス付きヌクレオチド配列のFASTAレコードを標準に出力します
アウト。 と -n、名前を出力するだけです。 と -s、インデックスの概要を出力するだけです
パラメータとシーケンス。 と -e、該当する場合は色を保持します。
OPTIONS
--大きなインデックス
「小さい」インデックスが存在する場合でも、「大きい」インデックスの検査を強制します。
-a/ - 横切って
FASTA出力の文字数（デフォルト：60）
-n/-名前
参照配列名のみを印刷する
-s/ - まとめ
要約を含む印刷参照名、長さ、インデックスプロパティ
-e/--ebwt-ref
ebwt から参照を再構築します (遅い、色は保持されます)
-v/-詳細
詳細出力（デバッグ用）
-h/ - ヘルプ
ツールとそのオプションの詳細な説明を印刷する
- 助けて この使用法メッセージを印刷する
64 ビット lgw01-11 木曜日 26 月 11 日 13:31:2015 UTC 5.2.1 コンパイラー: gcc バージョン 20151123 XNUMX でビルド
(Ubuntu 5.2.1-25ubuntu1) オプション: -O3 -Wl,--hash-style=両方 -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -O2
-fstack-protector-strong -Wフォーマット -エラー=フォーマットセキュリティ -g -O2 -fstack-protector-strong
-Wフォーマット -エラー=フォーマットセキュリティ -Wl,-Bsymbolic-関数 -Wl、-z、relro Sizeof {int、long、
ロングロング、void*、size_t、off_t}: {4, 8, 8, 8, 8, 8}
onworks.net サービスを使用して、bowtie-inspect-debug をオンラインで使用する
