これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド bp_chaos_plotp です。
プログラム：
NAME
bp_chaos_plot - DNA および RNA 配列からのカオス プロット
SYNOPSIS
bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=出力ファイル -g/--graphics=グラフィックフォーマット
-w/--width=幅 -h/--height=高さ
DESCRIPTION
このスクリプトは、GD 画像ライブラリを使用してヌクレオチドを視覚化する画像ファイルを生成します。
カオスプロットを使用したシーケンス。
OPTIONS
現在有効なグラフィック形式は、gd、gd2、png、wbmp、jpeg、gif です。
画像ファイルのデフォルトのサイズは 600x400 です。
シーケンス入力は、次の XNUMX つの方法のいずれかを使用して提供できます。
名前のない引数
bp_chaos_plot ファイル名
名前付き引数
bp_chaos_plot -i ファイル名
標準入力
bp_chaos_plot < ファイル名
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解像度。 バグレポートはWeb経由で送信できます。
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
著者 - ジェイソン スタジッチ
メール [メール保護]
歴史
このコードは、Ian Longden による Chaos.c の EMBOSS C コードに基づいています。 含まれるもの
EMBOSS コードからのドキュメント:
カオスはカオスプロットを生み出します。 元のアプリケーションは ACEDB ゲノムの一部です
データベース パッケージ、作成者: ** Richard Durbin (MRC LMB、英国) [メール保護],
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS、フランス) [メール保護]
onworks.net サービスを使用してオンラインで bp_chaos_plotp を使用する
