これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド cassiopee です。
プログラム:
NAME
cassiopee - Cassiopee バージョン 1.0 のマニュアル ページ
SYNOPSIS
カシオピー [オプション]
DESCRIPTION
使用法:
-l: 最大インデックス深さ / 最大パターン サイズ
-u: 後で使用できるようにインデックスを保存します
-s: インデックスへのシーケンス
-p: 検索するパターン
-f: 検索するパターンを含むファイル
-o: 出力ファイル
-r: ツリー削減を適用します
-m: 検索モード: 0=DNA、1=RNA、2=タンパク質
-a: アルファベットのあいまいさ検索を許可します
-n: 検索で許可される最大連続 N 個の一致
-e: 検索で許可される置換一致の最大数
-i: 検索で許可される最大インデル一致
-g: グラフのドットファイルを生成します
-d: グラフの最大深さ
-t: 出力形式: 0:tsv (デフォルト)、1:json
-x: シーケンス内の最小位置
-y: シーケンス内の最大位置
-v: バージョンを表示
-h: このメッセージを表示
onworks.net サービスを使用してオンラインで cassiopee を使用する