これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの 24 つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド cmtk-asegment_sriXNUMX です。
プログラム：
NAME
asegment_sri24 - SRI24 アトラスを使用したセグメンテーション
SYNOPSIS
asegment_sri24 TargetImage 出力イメージ
DESCRIPTION
SRI24 ヒューマンブレインアトラスの選択したチャンネルに対象画像を登録し、
アトラス ラベル マップの XNUMX つをターゲット イメージに再フォーマットします。 注: と仮定しています。
ターゲット画像は頭蓋骨が取り除かれており、脳のみが含まれています。
OPTIONS
Global BHツールキット オプション （これら shared by を CMTK ツール)
- 助けて
基本的なコマンドラインオプションのリストを標準出力に書き込みます。
--ヘルプ-オール
基本および高度なコマンドラインオプションの完全なリストを標準出力に書き込みます。
--ウィキ
コマンドラインオプションのリストをMediaWikiマークアップの標準出力に書き込みます。
- 男
マニュアルページのソースを「nroff」マークアップで標準出力に書き込みます。
--xml
コマンドライン構文仕様をXMLマークアップで記述します（スライサー統合用）。
- バージョン
ツールキットのバージョンを標準出力に書き込みます。
- エコー
現在のコマンドラインを標準出力に書き込みます。
--詳細レベル
詳細レベルを設定します。
-詳細, -v
詳細レベルを1増やします（非推奨。下位互換性のためにサポートされています）。
-スレッド
並列スレッドの最大数を設定します（POSIXスレッドおよびOpenMPの場合）。
メイン オプション
- 速い, -f
高速モード。
--登録チャネル
ターゲット画像への登録に使用される SRI24 チャネル。 サポートされている値:
「spgr」、「early-fse」、「late-fse」、「fa」、デフォルトは「spgr」、または次のいずれかを使用します。
次のとおりです。
--spgr
SPGR (T1 加重) 構造チャネル [この is ディフォルト]
--早い-fse
アーリーエコー (PD 重み付け) 高速スピン エコー チャネル
--late-fse
レイトエコー (T2 加重) 高速スピン エコー チャネル
--fa 拡散テンソル画像から導出されたフラクショナル異方性チャネル
--ラベルマップ
ターゲット イメージに再フォーマットされた SRI24 ラベル マップ。 サポートされている値:
「tzo116plus」、「lpba40」、「tissue」、デフォルトは「tzo116plus」、または次のいずれかを使用します。
以下
--tzo116plus
Tzourio-Mazoyer AAL 116 領域に基づく拡張皮質区画テンプレート
テンプレート。 [この is ディフォルト]
--lpba40
40 件の被験者 LONI 確率的ブレイン アトラス セグメンテーションに基づくテンプレート。
- 組織
SRI24 最尤 XNUMX コンパートメント (GM、WM、CSF) 組織セグメンテーション
マップ
作者
Torsten Rohlfing、Michael P. Hasak、Greg Jefferis、CalvinRからの寄稿。
Maurer、Daniel B. Russakoff、およびYaroslav Halchenko
onworks.net サービスを使用してオンラインで cmtk-asegment_sri24 を使用する
