これはコマンド cmtk-dwi_mask_bad_slices で、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できます。
プログラム：
NAME
dwi_mask_bad_slices - 一連の拡散強調画像内の不良スライスを見つけます。
SYNOPSIS
dwi_mask_bad_slices 拡散画像パス
DESCRIPTION
このツールは、一連の 3D 拡散強調 MR 画像を読み取り、不良スライスを見つけます。 悪いスライス
拡散画像内の平均強度が指定の範囲外であるものとして検出されます。
残りのすべての対応するスライスの平均の周囲の間隔
拡散イメージ。
OPTIONS
グローバル BHツールキット オプション （これら shared by を CMTK ツール)
- 助けて
基本的なコマンドラインオプションのリストを標準出力に書き込みます。
--ヘルプ-オール
基本および高度なコマンドラインオプションの完全なリストを標準出力に書き込みます。
--ウィキ
コマンドラインオプションのリストをMediaWikiマークアップの標準出力に書き込みます。
- 男
マニュアルページのソースを「nroff」マークアップで標準出力に書き込みます。
- バージョン
ツールキットのバージョンを標準出力に書き込みます。
- エコー
現在のコマンドラインを標準出力に書き込みます。
--詳細レベル
詳細レベルを設定します。
-詳細, -v
詳細レベルを1増やします（非推奨。下位互換性のためにサポートされています）。
-スレッド
並列スレッドの最大数を設定します（POSIXスレッドおよびOpenMPの場合）。
入力 オプション
--b0カウント
イメージリストの先頭にある b=0 イメージの数。 これらは含まれていません
不良スライスの検出またはマスキングは、出力ディレクトリにも書き込まれます。
利便性。 すべての b=0 画像がリストの先頭にあると想定されます。
入力画像はありますが、最後または途中ではありません。 [ディフォルト： 0]
--スライスの方向
拡散画像のスライス方向を定義します。 サポートされている値: 「軸方向」、
「矢状」、「冠状」、「スライス-x」、「スライス-y」、「スライス-z」。デフォルトは「軸方向」です。
または、次のいずれかを使用します。
-軸
軸方向スライス [この is ディフォルト]
-矢状
矢状スライス
-冠状
冠状スライス
--スライス-x
X座標軸はスライス方向です
--スライス-y
Y座標軸はスライス方向です
--スライス-z
Z座標軸はスライス方向 [この is ディフォルト]
悪い スライス 検出
--stdev
強度標準偏差を単位とした不良スライス識別のしきい値
残りの拡散画像からの対応するすべてのスライス。 [ディフォルト： 3]
出力 オプション
- に変換
出力イメージのスカラー データ型。 パディング値が負の場合でも、
たとえば、入力データが符号なしである場合は、必ず符号付きデータ型を選択してください。
出力。 デフォルトでは、出力データ型は入力データ型と同じです。 サポートされています
値: "char"、"byte"、"short"、"ushort"、"int"、"uint"、"float"、"double"、または使用
次のいずれか：
- char
8ビット、符号付き
- バイト
8ビット、符号なし
- 短い
16ビット、符号付き
-ushort
16ビット、符号なし
-int
32ビット符号付き
--uint
32ビット符号なし
- 浮く
32ビット浮動小数点
- ダブル
64ビット浮動小数点
--パディング値 , -p
出力イメージ内で検出された不良スライスのデータを置き換えるパディング値。 [ディフォルト： ～1】
- 出力ディレクトリ , -o
不良スライスをマスクしてイメージを書き込むためのファイル システム パス (つまり、
パディング値)。 [ディフォルト： なし]
作者
Torsten Rohlfing、Michael P. Hasak、Greg Jefferis、CalvinRからの寄稿。
Maurer、Daniel B. Russakoff、およびYaroslav Halchenko
onworks.net サービスを使用してオンラインで cmtk-dwi_mask_bad_slices を使用する
