これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド cmtk-volume_injection です。
プログラム:
NAME
volume_injection - ボリュームインジェクション
SYNOPSIS
volume_injection [オプション] refImage xform0 inImage0 [xform1 inImage1 ...]
DESCRIPTION
複数の同時登録 (低解像度) から高解像度ボリュームを再構築
フォワードボリュームインジェクションを使用した画像
OPTIONS
グローバル BHツールキット オプション (これら shared by を CMTK ツール)
- 助けて
基本的なコマンドラインオプションのリストを標準出力に書き込みます。
--ヘルプ-オール
基本および高度なコマンドラインオプションの完全なリストを標準出力に書き込みます。
--ウィキ
コマンドラインオプションのリストをMediaWikiマークアップの標準出力に書き込みます。
- 男
マニュアルページのソースを「nroff」マークアップで標準出力に書き込みます。
- バージョン
ツールキットのバージョンを標準出力に書き込みます。
- エコー
現在のコマンドラインを標準出力に書き込みます。
--詳細レベル
詳細レベルを設定します。
-詳細, -v
詳細レベルを1増やします(非推奨。下位互換性のためにサポートされています)。
-スレッド
並列スレッドの最大数を設定します(POSIXスレッドおよびOpenMPの場合)。
入力 オプション
--最初の画像を除外, -x
最初の画像を別の登録対象画像として再構成から除外します)
-パスウェイト , -W
パスのコントリビューションウェイトを「pass:weight」の形式で設定します
再建 グリッド オプション
--偵察グリッド
再構成グリッドを Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz] (dims:pixel:offset) として定義します。
--recon グリッド パス , -R
再構成された画像グリッドを定義するグリッドへのパスを指定します(オフセットを含む) [ディフォルト:
なし]
- 作物
ピクセル領域 x0,y0,z1:x1,y1,z1 への参照をトリミングします。
音量 注射 オプション
--等方性注入
等方性ボリュームインジェクションを使用します [デフォルト: パスイメージごとのピクセルサイズに応じてスケーリングされます]
寸法]
-- インジェクション-カーネル-シグマ , -S
ガウスの寄与 [ディフォルト: 1]
-- 注入カーネル半径 , -r
VolumeInjection影響を受けるピクセルの半径 [ディフォルト: 0]
出力 オプション
- 出力 , -o
出力画像パス [ディフォルト: volume_injection.nii ]
--イメージをフロートとして書き込む, -F
出力画像を浮動小数点として書き込む[デフォルト:入力と同じ]
作者
Torsten Rohlfing、Michael P. Hasak、Greg Jefferis、CalvinRからの寄稿。
Maurer、Daniel B. Russakoff、およびYaroslav Halchenko
onworks.net サービスを使用してオンラインで cmtk-volume_injection を使用する