これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド crb-blast です。
プログラム:
NAME
crb-blast - 条件付き相互ベスト BLAST
DESCRIPTION
CRB-Blast v0.6.4 by Chris Boursnell[メール保護]>
条件付き相互ベストBLAST
使用法: crb-blast
オプション:
-クエリ, -q :
fasta ファイルをクエリする
- 目標, -t :
ターゲットfastaファイル
--evalue, -e :
BLASTのe値カットオフ。 形式 1e-5 (デフォルト: 1.0e-05)
-スレッド, -h
BLAST を実行するスレッドの数 (デフォルト: 1)
- 出力, -o :
ファイルをtsvとして出力
- スプリット, -s:
fasta ファイルをチャンクに分割し、複数のブラスト ジョブを実行して結合します。
それら。
- バージョン, -v:
バージョンを印刷して終了します
- 助けて, -l:
このメッセージを表示する
onworks.net サービスを使用してオンラインで crb-blast を使用する