これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドデマックスです。
プログラム：
NAME
demux-XPLOR距離制限をGromacs形式に変換します
SYNOPSIS
デマックス md0.log 余分な
DESCRIPTION
軌道を再び連続させたい場合は、次を使用できます。 デマックス 読むには
md0.logファイル（必要に応じて複数を連結できます）を作成し、いくつかの出力を生成します
ファイル。 これらのXNUMXつは.xvgファイルです（レプリカ_ndx.xvg）に渡すことができます トライキャット(1) 沿って
連続した軌道を生成するために、元の軌道ファイルを使用します。 他の
ファイル（レプリカ_temp.xvg）各レプリカの温度が含まれています。
元の温度。 したがって、関心のあるレプリカがたとえば300 Kで始まる場合は、次のようにできます。
温度空間を通るその軌道。 いくつか追加すると面白いでしょう
各レプリカの温度分布のヒストグラムを作成する機能。
ほとんどの作者によると、フラットでなければなりません。 デマックスされた軌道は、
g_kinetics(1) REMDの軌跡からタンパク質のフォールディング速度を取得します。
OPTIONS
md0.log 連続させたい軌道走行のログファイル。 複数のファイルが可能
一緒に追加されます。
余分な ログファイルの各エントリがコピーされる回数。 （整数）
制限
交換がNpsごとで、M psごとに保存した場合、不足しているものを補うことができます
設定によるフレーム 余分な 〜（N / M-1）。 N / Mが整数でない場合、あなたは運が悪く、あなたは
弾道を完全に解除することはできません。
onworks.netサービスを使用してオンラインでdemuxを使用する
