これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド edialine です。
プログラム：
NAME
ediaalign - シーケンスのローカル多重アライメント
SYNOPSIS
編集する -シーケンス シーケンスセット -nucmode リスト -revcomp ブール値 [-overlapw 選択]
[-リンケージ リスト] [-maxfragl 整数] -フラグマット ブール値 -フラグシム 整数
[-そのスコア ブール値] [-しきい値 フロート] -マスク ブール値 -ドスターズ ブール値
-スターナム 整数 -outfile アウトファイル -outseq セコールトール
編集する -助けて
DESCRIPTION
編集する EMBOSS（「EuropeanMolecular BiologyOpen」のコマンドラインプログラムです。
ソフトウェアスイート」）。 これは、「Alignment:Multiple」コマンド グループの一部です。
OPTIONS
入力
-シーケンス シーケンスセット
NEW
-nucmode リスト
核酸配列アラインメント モード (単純、翻訳、または混合) デフォルト値: n
-revcomp ブール値
デフォルト値：N
-overlapw 選択
デフォルトでは、Nseq =<35 の場合にオーバーラップ ウェイトが使用されますが、これを「yes」に設定することも、
'no' デフォルト値: デフォルト (Nseq =< 35 の場合)
-リンケージ リスト
シーケンスツリーを構築するためのクラスタリング手法 (UPGMA、最小リンケージまたは最大リンケージ)
リンケージ) デフォルト値: UPGMA
-maxfragl 整数
デフォルト値：40
-フラグマット ブール値
デフォルト値：N
-フラグシム 整数
デフォルト値：4
-そのスコア ブール値
デフォルト値：N
-しきい値 フロート
デフォルト値：0.0
出力
-マスク ブール値
デフォルト値：N
-ドスターズ ブール値
デフォルト値：N
-スターナム 整数
デフォルト値：4
-outfile アウトファイル
-outseq セコールトール
onworks.net サービスを使用してオンラインで edialine を使用する
