これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド fastaq-add_indels です。
プログラム：
NAME
fastaq_add_indels - 指定された位置の塩基を削除または挿入します
DESCRIPTION
使用法: fastaq_add_indels [オプション]
指定された位置の塩基を削除または挿入します
ポジショナル 引数：
infile入力ファイルの名前
アウトファイル
出力ファイルの名前
任意 引数：
-h, - 助けて
このヘルプメッセージを表示して終了します
-d 名前:開始:ベース、 - 消去 名前:開始:ベース
指定された配列から指定された塩基を削除します。 samtools ビューと同じ形式:
名前:開始-終了。 このオプションは複数回（リージョンごとに XNUMX 回）使用できます。
消去）。 重複する座標は削除する前にマージされます
--delete_range P、スタート、ステップ
入力ファイルの各シーケンスの位置 P から始まる塩基を削除します。 削除
start + (n-1)*step 塩基をシーケンス n から取得します。
-i 名前:開始:ベース、 - 入れる 名前:開始:ベース
指定された位置にランダムな塩基文字列を挿入します。 フォーマットは
名前:位置:追加する番号。 塩基は位置の後に追加されます。 このオプションは次のとおりです
複数回使用
--挿入範囲 P、スタート、ステップ
入力ファイルの各シーケンスの位置 P の後に始まるランダムな塩基を挿入します。
start + (n-1)*step 塩基をシーケンス n に挿入します。
onworks.net サービスを使用してオンラインで fastaq-add_indels を使用する
