これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレータ、MAC OS オンライン エミュレータなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks の無料ホスティング プロバイダで実行できるコマンド fastaq-to_fasta です。
プログラム：
NAME
fastaq_to_fasta - さまざまな入力形式を適切にフォーマットされた FASTA 形式に変換します
DESCRIPTION
使用法: fastaq_to_fasta [オプション]
さまざまな入力形式を適切にフォーマットされた FASTA 形式に変換します
ポジショナル 引数：
infile 入力ファイルの名前。 FASTA、FASTQ、GFF3、EMBL、GBK、Phylip のいずれかを使用できます
アウトファイル
出力ファイルの名前
任意 引数：
-h, - 助けて
このヘルプメッセージを表示して終了します
-l LINE_LENGTH、 --line_length LINE_LENGTH
出力ファイルの各シーケンス行の塩基の数。 いいえの場合はゼロに設定します
シーケンス内の改行 [60]
-s, --strip_after_whitespace
すべてのシーケンス名の最初の空白以降をすべて削除します
-u, --check_unique
出力シーケンス名のいずれかが一意でない場合は終了します
onworks.net サービスを使用してオンラインで fastaq-to_fasta を使用する
