これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド fastaq-trim_contigs です。
プログラム:
NAME
fastaq_trim_contigs - すべてのコンティグの終わりから設定された数の塩基をトリムします
DESCRIPTION
使い方: fastaq_trim_contigs [オプション]
すべてのコンティグの終わりから一定数の塩基を切り取るので、ギャップが大きくなり、コンティグします
端が取り除かれます。 塩基は N に置き換えられます。 すべての N が失われてしまうシーケンス
ポジショナル 引数:
infile入力ファイルの名前
アウトファイル
出力ファイルの名前
任意 引数:
-h, - 助けて
このヘルプメッセージを表示して終了します
--trim_number TRIM_NUMBER
各ギャップの周囲でトリミングする塩基数、および各配列のオフエンド [100]
onworks.net サービスを使用してオンラインで fastaq-trim_contigs を使用する